Borromeo został mianowany administratorem archidiecezji mediolańskiej 7 lutego 1560 roku. Po podjęciu decyzji o wprowadzeniu w życie roli biskupa, postanowił przyjąć święcenia kapłańskie (4 września 1563), a 7 grudnia 1563 został konsekrowany na biskupa w Kaplicy Sykstyńskiej przez kardynała Giovanniego Serbelloniego. Borromeusz został formalnie mianowany arcybiskupem Mediolanu 12 maja 1564 r., po tym jak poprzedni arcybiskup Ippolito II d’Este zrzekł się swoich pretensji do tego arcybiskupstwa, ale papież pozwolił mu opuścić Rzym dopiero rok później. Borromeo oficjalnie wkroczył do Mediolanu jako arcybiskup 23 września 1565 roku.
Reforma w MediolanieEdit
Po śmierci swego wuja, Piusa IV (1566), Borromeusz przyczynił się materialnie do zdławienia kabały konklawe. Zanim Borromeo udał się do Mediolanu, gdy nadzorował reformy w Rzymie, pewien szlachcic zauważył, że to ostatnie miasto nie jest już miejscem, w którym można się dobrze bawić lub zbić majątek. „Carlo Borromeo podjął się przebudowy miasta od góry do dołu” – powiedział, przewidując, że entuzjazm reformatora „doprowadzi go do poprawienia reszty świata, gdy skończy z Rzymem”.
Później poświęcił się reformie swojej diecezji, która podupadła w praktyce z powodu 80-letniej nieobecności poprzednich arcybiskupów. Mediolan był wówczas największą archidiecezją we Włoszech, liczącą ponad 3 tys. duchownych i 800 tys. wiernych. Zarówno duchowieństwo jak i świeccy odeszli od nauczania Kościoła. Powszechne było sprzedawanie odpustów i stanowisk kościelnych; klasztory były „pełne nieładu”; wielu zakonników było „leniwych, ignoranckich i rozpustnych”. Borromeo przeprowadził liczne wizyty duszpasterskie i przywrócił godność służbie Bożej. Nalegał, aby kościoły były projektowane zgodnie z dekretami Soboru Trydenckiego, które stwierdzały, że sztuka sakralna i architektura pozbawiona odpowiednich podstaw biblijnych jest w praktyce zakazana, podobnie jak wszelkie włączanie klasycznych elementów pogańskich do sztuki religijnej. Podzielił nawę kościoła na dwa przedziały, aby oddzielić płcie podczas nabożeństw.
Rozszerzył swoje reformy na kolegiaty, klasztory, a nawet na Bractwa Pokutników, szczególnie na Bractwo św. Grupa ta miała zajmować się więźniami i skazanymi na śmierć, udzielać im pomocy i wsparcia.
Borromeusz uważał, że nadużycia w Kościele wynikają z ignorancji duchownych. Wśród jego najważniejszych działań było zakładanie seminariów, kolegiów i wspólnot w celu kształcenia kandydatów do święceń. Jego nacisk na naukę katolicką znacznie zwiększył przygotowanie mężczyzn do kapłaństwa i przyniósł korzyści ich zgromadzeniom. Ambrożego, stowarzyszenie świeckich mężczyzn, którzy nie przyjmowali święceń, ale poświęcali się Kościołowi i przestrzegali dyscypliny monastycznej modlitwy i studiów. Ambrożego, którzy nie przyjmowali święceń kapłańskich, ale poświęcali się Kościołowi i przestrzegali dyscypliny monastycznej modlitwy i studiów. Wysiłki nowego arcybiskupa na rzecz katechezy i nauczania młodzieży obejmowały zainicjowanie pierwszych klas „szkółki niedzielnej” oraz działalność Bractwa Doktryny Chrześcijańskiej.
Reformy diecezjalne Borromeo napotykały na opór kilku zakonów, zwłaszcza Humiliati (Braci Pokory), zakonu pokutnego, który, choć zredukowany do około 170 członków, posiadał około dziewięćdziesięciu klasztorów. Niektórzy z nich zawiązali spisek przeciwko jego życiu, a w kaplicy arcybiskupiej oddano do niego strzał. Jego ocalenie uznano za cudowne.
W 1576 roku w Mediolanie zapanował głód z powodu nieurodzaju, a później epidemii dżumy. Handel w mieście upadł, a wraz z nim źródło dochodu mieszkańców. Gubernator i wielu członków szlachty uciekło z miasta, ale biskup pozostał, aby zorganizować opiekę nad chorymi i posługę przy umierających. Zwołał przełożonych wszystkich wspólnot religijnych w diecezji i pozyskał ich do współpracy. Borromeo próbował nakarmić od 60 do 70 tysięcy osób dziennie. Zużył własne fundusze i zadłużył się, aby zapewnić pożywienie głodującym. W końcu napisał do gubernatora i skutecznie przekonał go do powrotu.
Wpływ na sprawy angielskieEdit
Borromeusz był również zaangażowany w sprawy angielskie, kiedy pomagał Piusowi IV. Wielu angielskich katolików uciekło do Włoch w tym czasie z powodu prześladowań pod rządami królowej Elżbiety I. Duszpastersko zajmował się angielskimi katolikami, którzy uciekli do Włoch, aby uciec przed nowymi prawami wymierzonymi w wiarę katolicką. Edmund Campion, jezuita, wraz z Ralphem Sherwinem odwiedzili go w Mediolanie w 1580 roku w drodze do Anglii. Zostali u niego przez osiem dni, rozmawiając z nim co wieczór po kolacji. Walijczyk Griffith Roberts służył jako jego kanonik teolog, a Anglik Thomas Goldwell jako wikariusz generalny. Arcybiskup nosił przy sobie mały obrazek przedstawiający Johna Fishera, który wraz z Tomaszem More’em został stracony za panowania Henryka VIII, a którego darzył wielką czcią. Podczas dziewiętnastowiecznej restauracji katolicyzmu w Anglii, kardynał Wiseman miał ustanowić zakon Oblatów św. Karola, kierowany przez Henry’ego Edwarda Manninga, jako kongregację świeckich księży bezpośrednio wspierających arcybiskupa Westminsteru.
Prześladowania dysydentów religijnychEdit
Chociaż sejm w Ilanz z 1524 i 1526 r. ogłosił wolność wyznania w Republice Trzech Lig, Borromeo represjonował protestantyzm w dolinach szwajcarskich. Encyklopedia Katolicka relacjonuje: „W listopadzie rozpoczął wizytację jako wizytator apostolski wszystkich kantonów Szwajcarii i Gryzonii, pozostawiając sprawy swojej diecezji w rękach monsignora Owena Lewisa, swojego wikariusza generalnego. Rozpoczął od doliny Mesoleina; tutaj nie tylko należało zwalczać herezję, ale także czary i magię, a w Roveredo odkryto, że „proboszcz lub rektor, był przodujący w czarach”. Podczas jego wizyty duszpasterskiej w tym regionie, 150 osób zostało aresztowanych za uprawianie czarów. Jedenaście kobiet i proboszcza skazano na spalenie żywcem.
Reagując na presję protestanckiej reformacji, Borromeusz zachęcał Ludwika Pfyffera do rozwijania Złotej Ligi, ale nie doczekał jej powstania w 1586 roku. Z siedzibą w Lucernie, organizacja ta (zwana również Ligą Borromejską) łączyła działania kilku katolickich kantonów Szwajcarii, która stała się centrum katolickich wysiłków kontrreformacyjnych. Organizacja ta była zdeterminowana, aby wydalić heretyków i spalił niektóre osoby na stosie. Stworzyło to poważne napięcia w administracji cywilnej konfederacji i spowodowało rozpad kantonu Appenzell wzdłuż linii religijnych.