Ludzie, którzy identyfikują się jako osoby transpłciowe lub transseksualne to zazwyczaj ludzie, którzy urodzili się z typową męską lub żeńską anatomią, ale czują się tak, jakby urodzili się w „niewłaściwym ciele”. Na przykład osoba, która identyfikuje się jako transpłciowa lub transseksualna może mieć typową kobiecą anatomię, ale czuje się jak mężczyzna i stara się stać mężczyzną, biorąc hormony lub decydując się na operacje zmiany płci.
Ludzie, którzy mają warunki interseksualne mają anatomię, która nie jest uważana za typowo męską lub żeńską. Większość osób z zaburzeniami interseksualnymi zgłasza się do lekarza, ponieważ lekarze lub rodzice zauważają coś niezwykłego w ich ciałach. W przeciwieństwie do nich, osoby transpłciowe mają wewnętrzne doświadczenie tożsamości płciowej, które różni się od większości ludzi.
Wielu ludzi myli osoby transpłciowe i transseksualne z osobami z zaburzeniami interseksualnymi, ponieważ widzą dwie grupy ludzi, którzy chcieliby wybrać własną tożsamość płciową i czasami te wybory wymagają leczenia hormonalnego i/lub operacji. To są podobieństwa. Prawdą jest również, choć rzadko, że niektóre osoby z zaburzeniami interseksualnymi również decydują się na zmianę płci w pewnym momencie swojego życia, więc niektóre osoby z zaburzeniami interseksualnymi mogą również identyfikować się jako osoby transpłciowe lub transseksualne.
Mimo tych podobieństw, te dwie grupy nie powinny i nie mogą być traktowane jako jedna. Prawda jest taka, że zdecydowana większość osób z zaburzeniami interseksualnymi identyfikuje się raczej jako mężczyźni lub kobiety, a nie jako osoby transpłciowe lub transseksualne. Tak więc, podczas gdy wszystkie osoby identyfikujące się jako transpłciowe lub transseksualne doświadczają problemów związanych z tożsamością płciową, tylko niewielka część osób interseksualnych doświadcza tych problemów.
Ważne jest również zrozumienie różnic pomiędzy tymi dwiema grupami, ponieważ pomimo pewnych podobieństw zmagają się one z wieloma różnymi problemami, w tym z różnymi formami dyskryminacji. Różnice między osobami transpłciowymi i transseksualnymi a interseksualnymi zostały zrozumiane przez ustawodawców w krajach takich jak Australia, gdzie ustawodawcy publicznie uznali, że osoby z zaburzeniami interseksualnymi mają inne potrzeby niż osoby identyfikujące się jako transpłciowe lub transseksualne.
Osoby identyfikujące się jako transpłciowe lub transseksualne również spotykają się z dyskryminacją i zasługują na równość. Wierzymy również, że osoby z zaburzeniami interseksualnymi i osoby identyfikujące się jako transpłciowe lub transseksualne mogą i powinny nadal współpracować w zakresie praw człowieka; jednakże istnieją ważne różnice, o których należy pamiętać, aby obie grupy mogły pracować na rzecz lepszej przyszłości.