W chwili śmierci w 1993 roku, Frank namawiał Gail do wycofania się z biznesu muzycznego, ale nigdy nie wyjaśnił, co ma zrobić z jego katalogiem wydawniczym. W 2002 roku Gail założyła Zappa Family Trust, którego celem jest nadzorowanie wydania jego nagrań, w tym wielu wcześniej niedostępnych utworów. Trust posiada tytuł i prawa autorskie do muzycznych i artystycznych produktów Franka Zappy, a także jego komercyjnego wizerunku. W lipcu 2015 roku ogłoszono, że Ahmet Zappa przejmie prowadzenie trustu. Rodzeństwo Ahmeta, Dweezil i Moon, publicznie wyraziło frustrację z powodu jego nominacji do tej roli.
Opisywana jako „kobieta biznesu o silnej woli i bystrości”, Gail Zappa „często ścierała się z głównymi graczami przemysłu muzycznego…”. Wysłała notatkę kończącą się słowami „Fuck you” do Steve’a Jobsa w związku z utworzeniem iTunes Store. Skrytykowała zespoły tribute grające muzykę Zappy, mówiąc: „To jest absolutnie kradzież tożsamości, ponieważ z mojego punktu widzenia, publiczność Franka Zappy zasługuje na to, aby usłyszeć muzykę – jeśli jest to po raz pierwszy, szczególnie – przedstawioną w sposób, który jest w jak najlepszym świetle tego, co kompozytor zamierzał.”
LawsuitEdit
W 2008 roku Zappa Family Trust pozwał organizatorów festiwalu Zappanale, odbywającego się poza Bad Doberan w Niemczech, żądając od nich zmiany nazwy festiwalu, usunięcia plakatów promocyjnych (które zawierały rzekomo zastrzeżone prawem handlowym wąsy podobne do wąsów Franka Zappy) oraz usunięcia jego popiersia, które stoi w centrum miasta od 2002 roku. W styczniu 2009 roku sąd przyznał rację Zappanale, po tym jak obrona argumentowała, że ponieważ Zappa Family Trust sprzedaje produkty tylko przez Internet i przyjmuje tylko dolary amerykańskie, od ponad pięciu lat nie korzystała skutecznie ze swoich znaków towarowych w Niemczech. Sąd orzekł również, że użycie wąsów w towarach Zappanale było wystarczająco odmienne, aby nie powodować pomyłek między nimi.