Chromatografia papierowa jest jedną z metod badania czystości związków i identyfikacji substancji. Chromatografia papierowa jest użyteczną techniką, ponieważ jest stosunkowo szybka i wymaga niewielkich ilości materiału. Rozdzielanie w chromatografii papierowej odbywa się na zasadzie podziału. W chromatografii papierowej substancje są rozprowadzane między fazą stacjonarną a fazą ruchomą. Fazą stacjonarną jest woda uwięziona pomiędzy włóknami celulozowymi papieru. Fazą ruchomą jest roztwór rozwijający się, który przemieszcza się w górę fazy stacjonarnej, unosząc ze sobą próbki. Składniki próbki będą się łatwo oddzielać w zależności od tego, jak silnie adsorbują się na fazie stacjonarnej w porównaniu z tym, jak łatwo rozpuszczają się w fazie ruchomej.
Gdy kolorowa próbka chemiczna jest umieszczona na bibule filtracyjnej, kolory oddzielają się od próbki poprzez umieszczenie jednego końca bibuły w rozpuszczalniku. Rozpuszczalnik dyfunduje w górę papieru, rozpuszczając różne cząsteczki w próbce zgodnie z polaryzacją cząsteczek i rozpuszczalnika. Jeśli próbka zawiera więcej niż jeden kolor, oznacza to, że musi mieć więcej niż jeden rodzaj cząsteczek. Ze względu na różne struktury chemiczne każdego rodzaju molekuł, istnieje duże prawdopodobieństwo, że każda molekuła będzie miała co najmniej nieco inną polarność, co daje każdej molekule inną rozpuszczalność w rozpuszczalniku. Nierówna rozpuszczalność powoduje, że w miarę przesuwania się rozpuszczalnika w górę papieru, cząsteczki różnych kolorów opuszczają roztwór w różnych miejscach. Im bardziej rozpuszczalna jest dana cząsteczka, tym wyżej będzie migrować w górę papieru. Jeśli substancja chemiczna jest bardzo niepolarna, to nie rozpuści się w ogóle w bardzo polarnym rozpuszczalniku. Tak samo jest w przypadku bardzo polarnej substancji chemicznej i bardzo niepolarnego rozpuszczalnika.
Jest bardzo ważne, aby zauważyć, że przy użyciu wody (bardzo polarnej substancji) jako rozpuszczalnika, im bardziej polarny kolor, tym wyżej będzie się wznosił na papierze.
Więcej informacji na ten temat można znaleźć na stronie internetowej.