Os pães germinados contêm o grão integral, germinado (o grão, ou baga) de várias sementes. São diferentes do pão branco, na medida em que os pães brancos são feitos de endosperma de trigo moído (após remoção do farelo e do germe). Os pães de grão inteiro incluem o farelo, o germe e o endosperma, fornecendo assim mais fibras, vitaminas e proteínas que ocorrem naturalmente. Os pães de cereais germinados (ou germinados) têm aproximadamente a mesma quantidade de vitaminas por grama. O pão de grão germinado tem 47% menos glúten do que o pão normal.
Uma comparação de análises nutricionais mostra que os grãos germinados contêm cerca de 75% dos hidratos de carbono, proteínas ligeiramente mais elevadas e cerca de 40% da gordura quando comparados com os grãos inteiros.
Além do trigo, os pães germinados podem conter grãos e leguminosas tais como painço, cevada, aveia, lentilhas e soja. O pão que é feito de uma variedade de grãos e leguminosas pode fornecer um conjunto completo de aminoácidos, os blocos de construção de proteínas. Os pães germinados podem conter um pouco mais de minerais e nutrientes que os pães não germinados. Para além disso, fornecem as mesmas vantagens que os pães de grão inteiro em relação aos pães de grão refinado, tais como menor risco de doença coronária.