Com o seu marido Jan e outros empregados da Opekta (Victor Kugler, Johannes Kleiman e Bep Voskuijl), Miep Gies ajudou a esconder Otto e Edith Frank; as suas filhas Margot e Anne; Hermann, Auguste e Peter van Pels; e Fritz Pfeffer em várias salas do andar de cima do edifício de escritórios da empresa em Prinsengracht, Amesterdão, de 6 de Julho de 1942 a 4 de Agosto de 1944. Numa entrevista, Gies disse que estava contente por ajudar as famílias a esconderem-se porque estava extremamente preocupada depois de ver o que estava a acontecer aos judeus em Amesterdão. Todos os dias, via camiões carregados de judeus a caminho da estação ferroviária, a caminho dos campos de concentração nazis. Ela não contou a ninguém, nem mesmo aos seus próprios pais adoptivos, sobre as pessoas escondidas a quem estava a ajudar.
p> Ao comprar comida para as pessoas escondidas, Gies evitou suspeitas de muitas maneiras: por exemplo, visitando vários fornecedores diferentes num dia. Ela nunca levou mais do que o que um saco de compras podia segurar ou o que podia esconder debaixo do casaco. Para evitar que os trabalhadores da Opekta se tornassem suspeitos, Gies tentou não entrar no esconderijo durante o horário de expediente. O seu marido também ajudou, fornecendo cartões de racionamento que tinha obtido ilegalmente. Ao visitar regularmente várias mercearias e mercados, Gies desenvolveu uma boa noção da situação de abastecimento.
No seu apartamento, perto do Merwedeplein onde os Franks tinham vivido antes de se esconderem, Gies e o seu marido (que pertencia à resistência holandesa) também esconderam um estudante universitário anti-Nazi.
A capturaEdit
Na manhã de 4 de Agosto de 1944, sentada à sua secretária, Gies, juntamente com Voskuijl e Kleiman, foi confrontada por um homem com uma arma a comandar “Fica quieta! Não se mexa!” As famílias tinham sido traídas e o Grüne Polizei prendeu as pessoas escondidas em 263 Prinsengracht, assim como Kugler e Kleiman. No dia seguinte, Gies dirigiu-se ao gabinete da polícia alemã para tentar encontrar os detidos. Ofereceu dinheiro para comprar a sua liberdade, mas não conseguiu. Gies e os outros ajudantes poderiam ter sido executados se tivessem sido apanhados a esconder judeus; contudo, ela não foi presa porque o polícia que a veio interrogar era de Viena, a sua cidade natal. Ela reconheceu o seu sotaque e disse-lhe que eles tinham a mesma cidade natal. Ele ficou espantado, depois começou a andar e a praguejar contra ela, decidindo finalmente deixá-la ficar. Gies permaneceu segura com o seu marido em Amesterdão durante o resto da guerra.
Antes de o esconderijo ser esvaziado pelas autoridades, Gies recuperou os diários de Anne Frank e guardou-os na gaveta da sua secretária. Ela estava determinada a devolvê-los à Anne. Depois de a guerra ter terminado e ter sido confirmado que Anne Frank tinha perecido em Bergen-Belsen, Gies deu a colecção de papéis e cadernos ao único sobrevivente do Anexo Secreto, Otto Frank. Depois de transcrever secções para a sua família, a capacidade literária da sua filha tornou-se aparente e ele providenciou a publicação do livro em 1947. Gies não leu os diários antes de os entregar a Otto e mais tarde observou que, se o tivesse feito, teria de os destruir porque os papéis continham os nomes dos cinco ajudantes, bem como dos seus fornecedores do mercado negro. Ela foi persuadida por Otto Frank a ler o diário na sua segunda impressão. Em 1947, Miep e Jan Gies mudaram-se para Jekerstraat 65, pela Merwedeplein , juntamente com Otto Frank.
Gies foi entrevistada sobre as suas memórias de esconder a família Frank para o documentário de 1995 Anne Frank Remembered de Jon Blair.