De aanvragende instelling is de instelling die de mentorfase (K99) uitvoert. Alle hierboven vermelde soorten instellingen/organisaties komen in aanmerking voor zowel de fase met mentorschap (K99) als de onafhankelijke fase (R00), met de volgende uitzonderingen: (1) In aanmerking komende agentschappen van de federale overheid, zoals het NIH intramurale programma, komen alleen in aanmerking voor de fase met mentorschap; en (2) Of organisaties, andere dan instellingen voor hoger onderwijs, in aanmerking komen voor de R00-fase hangt af van de aard van de aanstelling en het vermogen van de PD/PI om onafhankelijk onderzoek te verrichten en aanvragen in te dienen voor subsidies voor NIH-onderzoek (R01 of R01-equivalent).
Kandidaten voor de K99/R00-fase worden sterk aangemoedigd om bevestiging van hun geschiktheid te krijgen van het relevante IC voordat zij beginnen met de voorbereiding van hun aanvraag. Het is aan de kandidaat om aan te tonen dat hij/zij voldoet aan alle hieronder beschreven toelatingscriteria.
Een kandidaat met de vaardigheden, kennis en middelen die nodig zijn om het voorgestelde onderzoek als programmadirecteur/ hoofdonderzoeker (PD/PI) uit te voeren, wordt uitgenodigd om met zijn/haar mentor en organisatie samen te werken om een aanvraag voor steun op te stellen. Personen uit ondervertegenwoordigde raciale en etnische groepen en personen met een handicap worden altijd aangemoedigd om een aanvraag voor NIH-steun in te dienen. Meerdere PD’s/PI’s zijn niet toegestaan.
K99/R00 aanvragers mogen niet meer dan 4 jaar postdoctorale onderzoekservaring hebben op de relevante vervaldatum van de aanvraag, ongeacht of het een nieuwe of een hernieuwde aanvraag betreft. Om in aanmerking te komen voor het K99/R00-programma, moeten de kandidaten een postdoctorale opleidingspositie als mentor bekleden. Als een aanvrager onafhankelijk wordt (d.w.z. een faculteits- of niet-gemmentoreerde onderzoeksfunctie) voordat een K99-toekenning is toegekend, zal noch de K99-toekenning, noch de R00-toekenning worden toegekend.