In 1964, na de split van El Riot, vormden Thomas en toetsenist Mike Pinder de Moody Blues samen met drummer Graeme Edge, bassist Clint Warwick en gitarist Denny Laine. Deze groep zou in 1965 de hit “Go Now” en de LP The Magnificent Moodies uitbrengen, met Thomas als leadzanger in de Gershwin-cover “It Ain’t Necessarily So.”
De Moody Blues zouden al snel Laine vervangen door Justin Hayward en Warwick door Thomas’ El Riot-bandgenoot Lodge om zo de klassieke line-up van de band te vormen. Als fluitist, multi-instrumentalist en zanger in de Moody Blues, verscheen Thomas op alle albums van de progrockband – met inbegrip van hun klassieke LP’s zoals Days of Future Passed, In Search of the Lost Chord, A Question of Balance en Every Good Boy Deserves Favour – tot zijn pensioen in 2002.
Populair op Rolling Stone
Thomas schreef en zong ook Moody Blues-nummers als “Twilight Time,” “Legend of the Mind,” “Dr. Livingstone, I Presume,” “Dear Diary” en “And the Tide Rushes In.” Naast zijn tijd met de Moody Blues, bracht Thomas ook een paar soloalbums uit, 1975’s From Mighty Oaks en 1976’s Hopes, Wishes and Dreams, terwijl de groep halverwege de jaren zeventig op hiatus ging.
Thomas trok zich in 2002 terug uit de Moody Blues nadat hij leed aan een reeks gezondheidsproblemen. In 2013 onthulde Thomas dat hij leed aan “inoperabele” prostaatkanker. “De kanker wordt in remissie gehouden, maar ik zal deze behandeling voor de rest van mijn leven ondergaan,” schreef Thomas op zijn website.
In december kondigde de Rock and Roll Hall of Fame aan dat de klassieke line-up van de Moody Blues – Thomas, Hayward, Edge, Lodge en Pinder – zou worden opgenomen als onderdeel van de Class of 2018; Laine werd vervolgens dagen later toegevoegd aan het Rock Hall-rooster van de band.
Na de aankondiging zei Lodge in een interview dat hij hoopvol was dat zowel Thomas als Pinder – die de band in 1978 verliet – zouden terugkeren voor de inductieceremonie. “Als het lukt, zal het fantastisch zijn, want het is een natuurlijk iets om te doen. Ik probeer het niet te forceren – het zal zijn zoals het hoort te zijn,” zei Lodge. “Ze zijn een integraal deel van mijn leven geweest. Dat kun je niet negeren. Het zit er in opgesloten.” Hayward vertelde Rolling Stone ook dat hij open zou staan voor een reünie van de klassieke line-up van de Moody Blues.