De Morristown Line begint in Hoboken Terminal of in New York Penn Station. Treinen die vertrekken naar punten ten westen van Dover hebben diesellocomotieven nodig. Onmiddellijk na het verlaten van Hoboken passeert de route de bus- en dieselemplacementen alvorens de Bergen Tunnel uit 1908 onder de New Jersey Palisades in te gaan, net voorbij de East End interlocking. Bij het westelijke portaal van de Bergen Tunnel is de West End interlocking, waar de Main Line, Bergen County Line en Pascack Valley Line aftakken naar het noorden. De Morristown Line gaat vervolgens over de Lower Hack Lift, een verticale hefbrug die in 1927 over de Hackensack River werd gebouwd. De lijn gaat onder Route 7 door en passeert dan NJ Transit’s Meadowlands Maintenance Complex (MMC).
Amtrak’s Northeast Corridor en de New Jersey Turnpike kruisen elkaar boven het hoofd. De Midtown Direct treinen voegen zich bij de Morristown lijn vanuit New York bij Kearny Jct. net voorbij dit viaduct. De Morristown Line loopt hier een klein stukje parallel met de Amtrak Northeast Corridor en PATH lijnen en de Interstate 280. De Waterfront Connection ligt net voor het viaduct bij Meadows interlocking. Hiermee kunnen geselecteerde treinen van de North Jersey Coast Line en de Raritan Valley Line Hoboken bereiken vanaf de Northeast Corridor Line.
Na het volgen van de Interstate 280 gaat de lijn over een tweesporige draaibrug, de Morristown Line Bridge (Newark Drawbridge) over de Passaic River naar het gerenoveerde station Newark Broad Street met twee hoge perrons die alle drie de sporen bedienen. Na het Newark Broad Street Station, binnen de stadsgrenzen, loopt de lijn in een coupe en kruist onder vele straten, Interstate 280 en de Newark City Subway, en bij het verlaten Roseville Avenue station, nu de locatie van Roseville interlocking, splitst de Montclair-Boonton Line zich af naar rechts. Het traject ten westen van de Passaic River tot een korte afstand ten oosten van het Millburn station is driesporig. De rest van de route tot het station Lake Hopatcong is dubbelsporig.
Na het passeren van een verlaten station bij Grove Street (nu de locatie van Green interlocking) en over de Garden State Parkway, is East Orange de volgende halte, op een viaduct. Brick Church en Orange volgen, ook verhoogde stations. De lijn buigt af naar het zuiden over de Interstate 280 langs Highland Avenue en Mountain Station. South Orange is de volgende, een verhoogd station met twee perrons en drie sporen. Seton Hall University is hier gevestigd. Maplewood volgt, met een zijperron en een middenperron voor alle treinen in westelijke en sommige in oostelijke richting. Na Maplewood versmalt de lijn naar twee sporen bij de Millburn interlocking. Millburn en Short Hills hebben twee zijperrons, met twee sporen.
Summit, een belangrijk station is het volgende met twee hoge perrons en het stationsgebouw boven de sporen. Een glazen kruiswissel loopt boven de perrons langs. Sommige doordeweekse treinen eindigen en vertrekken hier. Veel van de privé-scholen in de omgeving zijn gevestigd in Summit en pendelende middelbare scholieren zijn een belangrijke bron van verkeer voor dit station. De dienstregeling is zodanig dat de meeste treinen uit Morristown gemakkelijk kunnen overstappen op een trein van de Gladstone-tak aan de overkant van het perron.
Ten westen van Summit splitst de Gladstone-tak zich af en steekt de lijn de Passaic River (voor de tweede keer) over naar Chatham. Chatham station ligt op een dijk met twee zijperrons. Madison op een viaduct is vergelijkbaar, met een onlangs gerenoveerd stationsgebouw uit 1916 aan de oostzijde.
De lijn passeert zijn eerste ongelijkvloerse kruising bij Convent Station bij het College of Saint Elizabeth. Dit station heeft twee zijperrons met het stationsgebouw aan de oostzijde en een bakstenen wachthuisje op het westelijke spoor. Een oud goederenstation ligt aan de oostelijke kant. Na dit station zijn er nog twee gelijkvloerse kruisingen.
Over de Interstate 287 komt de lijn in Morristown. Het station van Morristown heeft twee lage zijperrons en een groot stationsgebouw dat 7 dagen per week open is, en is het middelpunt van een nieuwe transit village ontwikkeling. Aan beide uiteinden zijn mini-hoogperron hellingbanen voor ADA toegang. Een verlaten goederenstation ligt aan de westkant. Ten westen van het station bevindt zich het hoofdkantoor van Morristown & Erie Railway. De hoofdlijn van de Morristown & Erie divergeert op dit punt.
Het volgende station op de lijn is Morris Plains, met een bakstenen station uit 1915. Een plaatselijke modelspoorclub is gevestigd in het goederenhuis iets ten noorden van het station. Na Morris Plains buigt de lijn door beboste gebieden, onder Route 10 door, en langs verschillende kruisingen voordat hij stopt bij Mount Tabor, een kleine halte in Denville bij de gelijknamige gemeente in Parsippany gelegen aan een spoorwegovergang. Deze halte wordt bediend door geselecteerde weekdag- en beperkte weekendtreinen en mist een oostwaarts perron.
Denville station ligt op korte afstand van Mount Tabor. De Morristown Line sluit net voorbij dit station weer aan op de Montclair-Boonton Line.
De lijn gaat over Estling Lake en langs de Rockaway River naar Dover. Dover, de laatste halte in elektrisch gebied, is de volgende. Het 1905 station werd onlangs gerenoveerd in het midden van de jaren 1990 en heeft een enkel hoog platform. Er rijden geen elektrische Midtown Direct treinen en de meeste Hoboken treinen rijden hier voorbij richting Hackettstown. De bovenleiding van de Morristown Line eindigt ongeveer een halve mijl ten westen van het station bij het viaduct over de US Route 46. Er zijn echter plannen (momenteel niet gefinancierd) om de elektrische dienst uit te breiden naar Lake Hopatcong omdat de Dover Yard zijn capaciteit heeft bereikt, en het onderstation in Wharton voor deze uitbreiding is sinds 1984 in gebruik.
Twee sporen gaan verder naar het westen over de Rockaway River en voorbij D&R Junction in Wharton waar de Dover-Rockaway Branch van Morris County zich afsplitst. Chester (Lake) Junction ligt aan de linkerkant en vormt de verbinding met de Chester en High Bridge Branch van Morris County. Mount Arlington park/ride station is het volgende, met twee hoge platforms en 285 parkeerplaatsen bij Exit 30 op Interstate 80.
Na het passeren van de Interstate 80, is Lake Hopatcong station het volgende. De verbinding met de Lackawanna Cutoff is aan de rechterkant als de trein Port Morris Yard nadert, waar de dieselvloot van de Montclair-Boonton en Morristown lijn is gestationeerd. Het station Netcong heeft een bakstenen huis op het lage perron. Tot eind 1994 was dit het eindpunt van de lijn. De lijn gaat onder de Interstate 80 door en komt in het Mount Olive International Trade Center, waar een station is aan de Waterloo Valley Road.
De route loopt door het Allamuchy Mountain State Park en langs de Musconetcong River naar Hackettstown. Een vrachtspoor naar de M&M/Mars fabriek ligt rechts, voordat de lijn US Route 46 in het centrum kruist. Het station van Hackettstown ligt verderop, met een laag perron en een mini-hoge ADA helling. Het spoor ten zuiden van Hackettstown is eigendom van Norfolk Southern en wordt geëxploiteerd door de Dover and Delaware River Railroad als onderdeel van de Lackawanna Washington Secondary naar Phillipsburg.
De Morristown-lijn is de hoofdlijn van de historische Lackawanna Railroad. Tot 1970 reed de passagiersdienst verder dan Dover, naar de Poconos, Scranton, Binghamton en Buffalo via de Lackawanna Cut-Off. Het is de bedoeling dat de Cut-Off in 2020 weer gaat rijden tot Andover, met plannen voor een eventuele uitbreiding tot het noordoosten van Pennsylvania, misschien zelfs tot Scranton.