Les colverts conduisent-ils les canards noirs à l’extinction génétique ?

Une étude approfondie cartographie les schémas de flux génétiques entre les colverts et les canards noirs.

Le roi des hybrides aviaires ? Clairement le Colvert (Anas platyrhynchos), cette espèce de canard s’est hybridée avec au moins 39 autres espèces. La plupart de ces hybridations concernent des espèces étroitement apparentées, comme le canard tacheté (A. fulvigula) ou le canard à bec tacheté (A. zonorhyncha). Avec tous ces croisements, on pourrait s’attendre à ce que le Colvert assimile toutes les autres espèces, ce qui conduirait à une extinction génétique. Cela a été proposé pour le Canard noir (A. rubripes) dans l’est des États-Unis (voir Mank et al. 2004). Une étude récente parue dans la revue Ecology and Evolution est revenue sur le cas du canard colvert x canard noir avec de nouvelles données génétiques.

Pas beaucoup de rétrocroisements

Philip Lavretsky (Université du Texas) et ses collègues présentent « l’étude moléculaire la plus complète des colverts et des canards noirs à ce jour » en collectant 290 échantillons dans l’aire de répartition des deux espèces. Les chercheurs ont quantifié le degré de flux génétique entre le colvert et le canard noir en assignant chaque individu à une classe générationnelle. Par exemple, espèce pure, hybride de première génération (F1), rétrocroisement avec le colvert, et ainsi de suite.

Cette analyse a révélé relativement peu de rétrocroisements. En fait, les individus qui se sont rétrocroisés avec le Canard noir ou le Canard colvert étaient génétiquement indiscernables des individus  » purs  » au bout d’une ou deux générations. Cela suggère qu’il y a peu de flux génétique entre les espèces. Contrairement aux travaux précédents, le Canard noir n’est pas assimilé par le Canard colvert. Cependant, cette analyse est basée sur seulement 0,04% du génome (en utilisant les données RADseq), donc ils pourraient avoir manqué des régions génomiques importantes.

ADNmt

Les analyses détaillées des échantillons de colverts ont révélé deux populations claires, que les chercheurs appellent les colverts occidentaux et non occidentaux. Les canards du groupe non-occidental, qui se trouvent principalement à l’est du fleuve Mississippi, sont porteurs d’un signal génétique qui suggère une hybridation avec des canards sauvages. Pour comprendre ce signal, je dois fournir quelques informations détaillées sur la structure de l’ADN mitochondrial (ADNmt) des canards colverts.

Sur la base de l’ADNmt, les canards colverts appartiennent à l’un des deux groupes, appelés haplotypes A et B. Les canards de l’Ancien Monde portent l’haplotype A, tandis que les deux haplotypes peuvent être trouvés dans les populations de canards du Nouveau Monde. La raison de ce schéma n’est pas encore résolue. Il se pourrait que les populations du Nouveau Monde ne soient constituées que de l’haplotype B mais que le flux génétique (historique ou récent) ait mélangé les choses. Ou encore, les populations du Nouveau Monde sont apparues relativement récemment et l’haplotype B ne s’est pas encore répandu dans l’aire de répartition (c’est-à-dire que le tri des lignées est incomplet).

Canards sauvages

Toute façon, la plupart des colverts non occidentaux portent l’haplotype A qui provient de l’Ancien Monde. La source la plus probable de cet haplotype est constituée par les canards sauvages, qui ont été (et sont encore) relâchés en Amérique du Nord. Les oiseaux des fermes à gibier sont originaires d’Eurasie et sont porteurs de l’haplotype A. Sur la base de ces schémas, les chercheurs proposent le scénario suivant : les hybrides ont tendance à se croiser avec les colverts et ces croisements se croisent avec les canards sauvages. Mais des échantillons d’oiseaux de fermes à gibier sont nécessaires pour confirmer cette hypothèse. Il y aura certainement d’autres études sur ce système. Gardez donc un œil sur le projet sur les hybrides aviaires.

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