El sifón inhalante se utiliza para tomar alimento y agua, y el sifón exhalante expulsa los desechos y el agua.
La túnica es una cubierta gruesa, generalmente opaca, que protege sus cuerpos en forma de barril de los depredadores. Está hecha de un material muy similar a la celulosa. En la superficie interna de la túnica hay una fina epidermis, que es la que segrega la túnica. En el interior de la epidermis hay una dermis más gruesa (pared del cuerpo) y bandas de músculos que pueden apretar la túnica forzando un chorro de agua desde el sifón exhalante.
La mayor parte del espacio dentro del cuerpo del tunicado está ocupado por el atrio (una gran cavidad). Esta contiene la faringe ampliada, que tiene un gran número de pequeños poros o rendijas en sus paredes a través de los cuales puede pasar el agua. Está conectada al sistema digestivo en un extremo y al sifón inhalador en el otro, esto es efectivamente la boca del animal.
La faringe de los tunicados está cubierta por diminutos pelos (células ciliadas) que permiten el paso del alimento consumido hasta el esófago. El sistema digestivo tiene forma de U, el ano se vacía directamente al exterior.
Los tunicados son filtradores, se alimentan extrayendo a menudo cientos de litros de agua cada día a través del sifón inhalante. Esta agua pasa por la faringe, donde se filtran las pequeñas partículas, antes de que el agua sea expulsada por el sifón exhalante. La corriente de agua es provocada por los cilios que laten. El agua también puede ser expulsada de la cavidad auricular mediante contracciones musculares de la túnica si el tunicado se ve amenazado. Las pequeñas partículas de plancton, etc., quedan atrapadas en una capa de mucosa en continuo movimiento. Esta mucosa es liberada por células especiales y se mueve por la superficie de la faringe mediante el batir de muchos cilios pequeños, hasta que pasa al sistema digestivo donde las partículas de comida y la mucosa son digeridas.