Der Einatem-Siphon dient der Aufnahme von Nahrung und Wasser, der Ausatem-Siphon stößt Abfall und Wasser aus.
Die Tunika ist eine dicke, meist undurchsichtige Hülle, die ihre tonnenförmigen Körper vor Fressfeinden schützt. Sie besteht aus einem Material, das der Zellulose sehr ähnlich ist. Auf der Innenseite der Tunika befindet sich eine dünne Epidermis, sie ist es, die die Tunika absondert. Auf der Innenseite der Epidermis befindet sich eine dickere Dermis (Körperwand) und Muskelbänder, die die Tunika zusammendrücken können, um einen Wasserstrahl aus dem Ausatmungssiphon zu erzwingen.
Der meiste Raum innerhalb des Tunikakörpers wird vom Atrium (einem großen Hohlraum) eingenommen. Dieser enthält den vergrößerten Pharynx, der in seinen Wänden viele kleine Poren oder Schlitze hat, durch die Wasser hindurchtreten kann. Er ist an einem Ende mit dem Verdauungssystem und am anderen Ende mit dem Einatmungssiphon verbunden, das ist quasi der Mund des Tieres.
Der Rachen des Manteltiers ist mit winzigen Härchen (Wimpertierchen) bedeckt, durch die die aufgenommene Nahrung in die Speiseröhre gelangen kann. Das Verdauungssystem ist U-förmig, der Anus entleert sich direkt nach außen.
Tunikaten sind Filtrierer, sie ernähren sich, indem sie oft hunderte von Litern Wasser pro Tag durch den Einatmungssiphon ziehen. Dieses Wasser wird durch den Pharynx geleitet, wo kleine Partikel herausgefiltert werden, bevor das Wasser durch den Exhalationssiphon ausgestoßen wird. Der Wasserstrom wird durch schlagende Flimmerhärchen verursacht. Wasser kann auch durch Muskelkontraktionen der Tunika aus der Vorhofhöhle herausgedrückt werden, wenn die Tunika bedroht ist. Die kleinen Partikel von Plankton usw. werden auf einer sich ständig bewegenden Schleimschicht festgehalten. Dieser Schleim wird von speziellen Zellen freigesetzt und durch das Schlagen vieler kleiner Flimmerhärchen über die Oberfläche des Rachens bewegt, bis er in den Verdauungstrakt gelangt, wo die Nahrungspartikel und der Schleim verdaut werden.