Vroege geschiedenisEdit
Volgens mondelinge overlevering stond op de plaats waar nu de Sint-Cyril en Methodiuskathedraal staat, een kleine kerk die door Bořivoj I, hertog van Bohemen, was gebouwd en door de heilige Methodius zelf was gewijd. Dit verband is historisch gebaseerd op een vroege en voortdurende verwijzing naar de naam “Na Zderaze” voor het bestaande kerkgebouw. In 1091 werd de Tsjechische heer Zderad gedood tijdens de belegering van Brno, en werd hij begraven in de vroegere kerk, die in de buurt van Praag stond. Zderad’s naam werd vervolgens vereeuwigd in de naam van de straat “Na Zderaze” die aan de kathedraal grenst, waarmee een band werd gelegd met deze door de heilige Methodius gewijde plaats.
Vanaf 1115 stond op de plaats van de huidige kerk de kerk van de heiligen Petrus en Paulus, waaromheen de kruisridders het Zderazsky-klooster bouwden. Tijdens de Hussietenoorlogen werd de kerk grotendeels verwoest, zodat alleen een deel van het koor overeind bleef. In 1705 vestigde de rooms-katholieke aartsbisschop van Praag, Breuner, een rusthuis voor priesters op de plaats van het klooster, waarnaast later een kerk werd gebouwd.
De Tweede WereldoorlogEdit
In 1942, tijdens de Tweede Wereldoorlog, was de kathedraal de plaats waar een laatste stand werd gemaakt door de door SOE getrainde Tsjechische en Slowaakse agenten die betrokken waren bij de moord op SS-Obergruppenführer Reinhard Heydrich. SS- en politieleider van de Waffen-SS Karl Fischer von Treuenfeld voerde het bevel over de nazi-troepen die op 18 juni 1942 de kerk bestormden. Na een hevig vuurgevecht werden twee van de Tsjechoslowaken gedood en pleegde de rest zelfmoord om niet gevangen genomen te worden.
In de crypte van de kerk is een museum aan hen als nationale helden gewijd.